METODOLOGÍA PARA SEPARACIÓN DE PIGMENTOS FOTOSINTÉTICOS

La fotosíntesis funciona en primer lugar gracias a la existencia de pigmentos específicos, que tienen la capacidad de absorber la energía de los fotones. Los pigmentos de mayor importancia son las clorofilas: la clorofila A que tiene un color verde azulado, y la clorofila B de color verde amarillento. También son importantes los carotenoides, de color anaranjado-rojizo, y las xantofilas de color amarillo. Las algas y bacterias fotosintéticas contienen además otros pigmentos que les permiten ampliar el espectro de longitudes de onda cuya energía pueden absorber.

Para la separación de los diferentes pigmentos fotosintéticos, se pueden emplear diferentes técnicas cromatográficas, ya sea en columna, de gases, en fase liquida etc, las más sencillas son la de placa fina y la cromatografía en papel, que es la que vamos a usar. 

En todos los tipos de cromatografía hay una fase móvil que consiste en un fluido (gas, líquido o fluido supercrítico) que arrastra a la muestra a través de una fase estacionaria que se trata generalmente de un sólido o también de un líquido fijado en un sólido. Los componentes de la mezcla a separar, interaccionan en distinta forma con la fase  móvil y la estacionaria, ya sea por diferencias en carga eléctrica, densidad o solubilidad. De este modo, los componentes atraviesan la fase estacionaria a distintas velocidades y se van separando. Diferencias sutiles en la afinidad de los componentes de la mezcla con las fases móvil y estacionaria del sistema, da como resultado una retención diferencial sobre la fase estacionaria y por tanto una separación efectiva en función de los tiempos de retención de cada componente de la mezcla.

En la cromatografía en placa fina, la fase estacionaria es una placa de vidrio o metal con una capa de sílice (sobre la que corre la fase móvil), en la de papel es el papel filtro (papel de celulosa de alta pureza), y la fase móvil es algún solvente en el que los componentes de la mezcla sean solubles, pero con diferencias en el grado de solubilidad con este, para ello pueden usarse mezclas de solventes y es importante buscar la que permita una mejor separación de los componentes.

Al entrar en contacto con los disolventes empieza su fase de movilidad, lo que produce unas manchas características sobre el papel, generalmente cuando estas no son coloreadas se revelan con una lámpara fluorescente, los contornos de las manchas se marcan con lápiz, para después medir y calcular el Rf.  Como medida de referencia, para identificar las sustancias separadas del compuesto problema en la cromatografía sobre papel, se emplea el Rf (Retention factor)  el cual se define como el cociente obtenido al dividir la distancia recorrida por la sustancia, entre la recorrida por el disolvente, esto es, la distancia medida desde el origen hasta el límite de la mancha (X) dividida entre la distancia medida desde el origen hasta el frente del disolvente (S). 𝑅𝑓 = 𝑋/S

En esta práctica, se pretende separar los pigmentos fotosintéticos, para ello se emplearán dos solventes, acetona (propanona) para extraer los pigmentos de las hojas y éter de petróleo como fase móvil de la cromatografía.

La metodología es como sigue:

Para la extracción

• Se seleccionan las hojas de las que se extraerán los pigmentos, no deben estar maltratadas ni con manchas que indiquen alguna parasitosis o enfermedad. Se les retira la nervadura central (que se desecha) y  se cortan en secciones pequeñas, se pesan 10 gramos y se ponen en el mortero con 5 ml de acetona, se trituran con el pistilo del mortero hasta que el líquido se vea de un color intenso, si es necesario se puede agregar 5 ml más de acetona.

• Se eliminan los restos de las hojas tratando de presionarlas para exprimir el líquido.

• El líquido se deja evaporar a que queden 2 ml (lo que cabe en el microtubo que se les dará).

• Se vacía el extracto al microtubo Eppendorf con ayuda de un gotero o pipeta Pasteur.

Para la cromatografía

• Cada equipo tendrá el extracto de una planta, pero todos los equipos correrán el cromatograma de todos los extractos, es decir cada equipo correrá 6 cromatogramas.

• Cada equipo tendrá 6 papeles ya cortados y marcados, en la parte posterior y con lápiz pondrán el nombre del extracto correspondiente y el número de su equipo.

• Toman un capilar y lo sumerjen en el microtubo con el extracto correspondiente, lo retiran tapando el extremo superior con el dedo.

• Con cuidado colocarán la punta del capilar sobre el punto marcado en el papel, retiran el dedo y retiran el capilar, de manera que solo quede una mancha pequeña sobre el papel.

• Se agita levemente el papel hasta que la mancha se seque.

• Se repite10 veces el procedimiento sobre el mismo punto y secando entre cada aplicación, ya que el objetivo es lograr que se concentre el extracto en un mismo punto, pero tratando que la mancha sea lo más pequeña posible, evitando que se difunda y se extienda el extracto. Conforme el extracto se concentre lo más posible en la menor superficie, se obtendrá un cromatograma más nítido.

• En el vaso de precipitados de ____ ml verter 20 ml de éter de petroleo. Poner el vaso sobre una superficie plana e introducir el papel con el extracto de manera que el punto donde se colocó el extracto quede hacia abajo y el papel lo más recto posible sin que se doble. Esta operación debe hacerse en un solo movimiento, una vez que el papel ha tocado el éter de petróleo no debe moverse.

• Tapar el vaso con un vidrio de reloj para que el vapor del solvente sature el interior del vaso y se deja correr el cromatograma hasta que el solvente toque la línea marcada en la parte superior del papel.

• EN TODO EL PROCEDIMIENTO DEBE EVITARSE MOVER EL VASO CON EL CROMATOGRAMA PUES SE INTERRUMPE LA DIFUSIÓN DEL SOLVENTE Y EL CROMATOGRAMA SE DISTORSIONA.

• Sacar el cromatogama del vaso y dejar secar, cuando se haya secado marcar con lápiz delimitando las áreas de cada color (verde azulado, verde amarillento, amarillo y naranja).

• Medir desde el punto de origen la distancia recorrida por el solvente y por cada uno de los pigmentos.

• Calcular el Rf de cada pigmento en todos los cromatogramas.

• En una tabla colectar los datos de Rf obtenidos por todos los equipos.

Comparar todos los cromatogramas con los de de la zanahoria y de la espinaca que se usarán como referencia.

Ahora vean la información contenida en el siguiente enlace:    https://www.uam.es/docencia/jppid/documentos/practicas/actuales/guion-p6.pdf

En este caso lo primero que hay que entender es que el Rf (factor de retención) y este valor no es más que la posición en que queda el pigmento con respecto a lo que recorrió el solvente. es decir. es el lugar donde queda la mancha de cada pigmento en particular dentro del cromatograma. Este valor es el que nos permite identificar a la sustancia (en este caso el pigmento) en cuestión.
En otras palabras cada pigmento cuando se corre exactamente bajo el mismo sistema (tipos de solventes, tipo de papel, temperatura, cantidades de solventes, grado de concentración de las muestras, etc.), debe tener siempre el mismo Rf, sea que provenga de la espinaca (control) o de cualquiera de las otras hojas que emplearon, por lo que no debería haber dispersión en los datos.
Por esta razón y para validar los datos que obtuvieron, van como primer paso, a calcular la media y la D.E. de cada pigmento, incluyendo los de todos los tipos de hoja, lo importante aquí será que aunque si hay variación, ustedes puedan inferir que con cierta confianza, pueden en efecto identificar cada pigmento en las hojas y saber cuales están presentes en cada una. En la conclusión, también contemplen que no es el único criterio por que otro criterio en el caso de los pigmentos es el color.

Les pongo un ejemplo de como podría ser la Tabla:

		Pigmentos Rf
Tipo de hoja	Repeticiones	clorofila	clorofila	xantofila	caroteno
Espinaca	Eq. 1
	Eq. 2
	Eq. 3
	Eq. 4
	Eq. 5
hoja roja	Eq. 1
	Eq. 2
	Eq. 3
	Eq. 4
	Eq. 5
hoja amarilla	Eq. 1
	Eq. 2
	Eq. 3
	Eq. 4
	Eq. 5
	Media
	Desv. Est.

La gráfica quedaría semejante a la siguiente:

Después discuten esta gráfica considerando las Desviaciones estándar como indicadoras de errores, pero evidenciando el patrón que les permite reconocer las diferencias entre cada pigmento. 

Ahora, para responder a su pregunta de investigación, la cual depende de lo que trabajó cada salón,  deberían haber puesto en su marco teórico cuales son los pigmentos que intervienen en la fotosíntesis directamente, cuales son accesorios y como intervienen, su espectro de absorción y explicar porque podría o no haber diferencias en el número de pigmentos que hay en unas plantas y otras, independientemente de las diferencias en su  color y en base a esa información haber planteado una hipótesis.

Para responder a esto,  deberán hacer otra tabla, donde por cada tipo de hoja o tejido ponen el número de pigmentos que encontraron (0, 1, 2, 3 o 4) es decir una tabla como la que sigue en cada equipo 

	Espinaca	Zanahoria	planta 1	planta 2	planta 3	planta 4
Clorofila Beta	1	0	1	1	0	1
Clorofila Alfa	1	0	1	1	1	1
Xantofilas	1	0	0	1	0	0
B Cartoteno	1	1	0	1	0	1
Total	4	1	2	4	1	3

Dado que cada equipo es una repetición, construyen otra tabla con los datos de todos, calculan media y desviación estándar 

	equipo 1	equipo 2	equipo 3	equipo 4	equipo 5	equipo 6	Media	Desv. Est.
Espinaca	4
Zanahoria	1
planta 1	2
planta 2	4
planta 3	1
planta 4	3

y presentan los resultados también en una gráfica de columnas con las barras de error de la desviación estándar. en base a esta tabla primero interpretan, luego discuten y concluyen respondiendo a su pregunta y dando la explicación biológica y continúan con análisis de fuentes de error, mejoras y sugerencia de ampliación. Finalmente la bibliografía que debe mostrar autores, año de publicación, título del artículo, dirección de Internet, fecha de consulta etc, dependiendo del tipo de fuente también otros datos como volumen, página.

El reporte debe contener todos los elementos que ya conocen.

METODOLOGÍA BÁSICA FOTOSINTESIS

Hola chicos les pongo la metodología básica para la práctica que montaran la próxima semana (a partir del 29 d enero) el problema de investigación es: es
 "Incremento de biomasa y altura de plántulas emergidas de semillas de una mezcla de 3 especies de pasto expuestas durante 3 semanas a 5 diferentes colores de luz (azul, amarillo, verde rojo y blanca" (agregar el nombre de las especies que contiene la caja y cambiar la redacción de manera en que sea una pregunta de investigación y expliquen como y porque se controlan las variables).

Como verán a la metodología le faltan algunos datos que ustedes irán completando al momento de montarla, pero la información que les mando es suficiente para que puedan llevarla a cabo.

Metodología abreviada. (en el reporte deberán completarla, explicarla y redactarla con sus propias palabras, esto de manera individual)

Cada equipo montará un frasco con semilla de pasto como sigue:

1.- Recortar una toalla de papel  a un tamaño de 20cm  X 40cm

2.- Doblarla en cuatro, un doblez longitudinal y uno transversal, con lo que debe quedar de 10cm X 20 cm, colocarla en el interior de un frasco de plástico transparente con tapa, con capacidad de 1 galón y las siguientes dimensiones:  diámetro_____,  y altura _____, La toalla de papel debe ponerse de manera que quede sobre un lado.

3.- Medir 30 ml de agua y verterla sobre el papel de manera uniforme.

4.- Pesar 3 gr de semilla de pasto y rociarla de manera que quede distribuida lo más homogéneamente posible sobre la toalla de papel húmeda. cuidando de no salirse.

5.- Marcar el frasco con el número de equipo y salón con un masking tape en la tapa.

6.- Se colocarán 5 frascos dentro de cada caja de cartón cuyas medidas son _____cm de altura por______cm de ancho y ______cm de fondo.

En la parte superior central de cada caja, se colocará un foco de diferente color con una extensión, de manera que el foco quedará a _______cm de distancia de los frascos.

De esta manera en cada grupo se montarán 6 frascos (uno por equipo), y en total entre los 4 grupos serán 24 frascos, se añadirá uno más (montado por un equipo voluntario),  de manera que queden 25 frascos que se distribuirán en 5 cajas de cartón, cada uno de los cuales tendrán un foco de diferente color pero de la misma intensidad.

6.- Después de 3 semanas se extraerán el papel junto con las plantas de pasto de cada frasco, y con mucho cuidado se irá separando todo el material vegetal del papel y se medirá la altura máxima y mínima de los pastos, se anotara el promedio de ambas, luego se pesará el total de pasto de cada frasco incluyendo tallo, hojas, raíces y las semillas que no hayan germinado, de este modo se tendrán un total de 25 datos de altura y 25 de peso (5 por cada color de luz)

Para la Práctica de respiración.

Para esta práctica ustedes van a poner el titulo completo de acuerdo a las variables que manejen.   Los puntos que deben investigar son:

• ¿Que son las levaduras?
• ¿Que tipos de respiración realizan?
• ¿Cual es la diferencia entre esos tipos de respiración?
• ¿Cuales son los productos de estos tipos de respiración?
• ¿Que otros sustratos (además de la glucosa) pueden utilizar para poder realizar la respiración?
• ¿Que efecto tiene la cantidad o concentración de sustrato que se ponga en el medio donde se cultivan?

No se basen únicamente en lo que se vio en el laboratorio, amplíen la investigación con información de libros o artículos.

OJO, cuando reporten su práctica NO PONGAN LA INFORMACIÓN DEL  MARCO TEÓRICO como pregunta y respuesta, sino lo redactan de manera que queden integrados todos los conceptos en un texto fluido, coherente y claro.

Dos grupos (3010 y 3040) van a trabajar cambiando las cantidades de sustrato, que en este caso será sacarosa (0.0 0.3, 0.6, 0.9, 1.2  y 1.5 gramos) los otros 2 grupos (3020  y 3030) van a trabajar con diferentes sustratos (glucosa, fructosa, maltosa, sacarosa  y almidón).

Les añado aquí una metodología que esta descrita de manera general para las 2 variables independientes que van a usar, incluyendo cantidades, pero ustedes tienen que modificarla en función de lo que les toca hacer a cada grupo:

Cada equipo (mesa) va a preparar una mezcla de agua con levadura en una proporción de 2 gramos de levadura por cada 100 ml de agua (deben calcular la cantidad que van a necesitar dependiendo del número de tubos de ensayo y de la cantidad de esta mezcla que se les va a poner).

Tomen en cuenta que cada mesa hace una repetición, es decir en el caso de los que tengan diferentes concentraciones tendrán un tubo para cada cantidad de sacarosa, los que tienen diferentes carbohidratos tendrán un tubo para cada carbohidrato, así que etiqueten los tubos según corresponde de manera clara y poniendo el maskinTape en la parte superior para que no se desprenda en el agua cuando los pongan a incubar.

En los tubos de ensayo ya etiquetados convenientemente  (de los grandes y que sean todos del mismo diámetro)  vacían en cada uno 15 ml de la mezcla de levadura y las ponen a baño María en un vaso de precipitados de 500 ml con agua a 30°C y lo dejan hasta que la mezcla dentro de los tubos alcance esa temperatura.

Mientras la mezcla se atempera, pesan el o los sustratos (según el grupo)

• En el caso de los equipos con diferentes cantidades van a pesar las 5 cantidades (0.0 0.3, 0.6, 0.9, 1.2  y 1.5 gramos) de sacarosa en tapas de cajas de Petri etiquetadas apropiadamente.
• En el caso de los que van a trabajar con diferentes sustratos pesan 0.3 g de cada uno.

En tubos de ensayo con la mezcla de levadura ya atemperados agregan el sustrato que corresponda a cada tubo (para ello usen un embudo que pueden hacer con un papel) y, mezclan golpeando levemente con el dedo la parte baja del tubo mientras lo sostienen con la otra mano asiéndolo por el otro extremo..

En vasos de precipitados de 500 ml ponen agua a 35°C y colocan ahí los tubos, los dejan incubar cuidando que la temperatura se mantenga entre 30 y 35°C durante 30 minutos (este tiempo se podrá ajustar en caso de que se formara demasiada espuma, pero siempre cuidando que sea el mismo en todos los equipos).

Transcurrido ese tiempo se mide con una regla la altura alcanzada por la espuma tomándola a partir de donde termina la fase líquida e inician las burbujas. En este punto hay que hacer una aclaración, si la variable dependiente es el volumen de CO₂ que se libera, ¿Qué pueden hacer para transformar los  cm lineales que subió la espuma a ml?.

Como cada equipo hace una repetición, al final se tendrán 6 repeticiones de cada variación de su variable independiente, y tengan en cuenta que de acuerdo a la naturaleza de su variable independiente ustedes deberán decidir que tipo de gráfica emplearán cuando procesen sus datos..